惜しくも4年ぶりのファーム日本一はなりませんでした。10月6日（土）に松山・坊っちゃんスタジアムで行われた「2012ファーム日本選手権」でマリーンズに0対4に敗れました。

ホークスの先発は二保旭投手。ウエスタンで11勝0敗、防御率1.44と抜群の安定感を誇った右腕でしたが、この日はコントロールに苦しみます。立ち上がりは何とか粘り切りましたが、4回表に2安打と2四球を許して2点を奪われて、この回までで降板しました。

攻撃はマリーンズ先発の植松投手の前に打線が繋がらず、後続の投手も崩せずにわずか4安打での零封負け。4回裏に先頭の安田圭祐選手が中前打を放ち、すぐに盗塁を決めて無死二塁とした好機も生かせませんでした。安田選手はこの1安打1盗塁の活躍で『優秀選手賞』に選ばれました。

小川一夫2軍監督は「今日は勝ちにいったし勝ちたかったが、残念な結果に終わりました。ただ、いつも言うように若い選手たちには経験が大切なこと。ここで終わる選手たちじゃない。これを1つの学びとして、また一歩進むという考え方でいいのではないかな」と話しました。

チームは同日中に帰福。7日（日）には宮崎に移動し、8日（月）から始まる「みやざきフェニックスリーグ」に臨みます。